Protein–RNA interactions for Protein: P50135

HNMT, Histamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNMTP50135 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNMTP50135 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNMTP50135 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNMTP50135 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNMTP50135 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNMTP50135 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNMTP50135 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNMTP50135 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNMTP50135 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNMTP50135 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNMTP50135 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNMTP50135 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNMTP50135 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNMTP50135 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNMTP50135 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNMTP50135 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNMTP50135 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNMTP50135 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNMTP50135 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNMTP50135 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNMTP50135 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNMTP50135 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNMTP50135 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNMTP50135 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNMTP50135 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HNMTP50135 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNMTP50135 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNMTP50135 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNMTP50135 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HNMTP50135 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNMTP50135 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNMTP50135 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNMTP50135 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNMTP50135 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HNMTP50135 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNMTP50135 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNMTP50135 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNMTP50135 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNMTP50135 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNMTP50135 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HNMTP50135 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNMTP50135 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HNMTP50135 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNMTP50135 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNMTP50135 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNMTP50135 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNMTP50135 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNMTP50135 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNMTP50135 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNMTP50135 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNMTP50135 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNMTP50135 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNMTP50135 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNMTP50135 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNMTP50135 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNMTP50135 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNMTP50135 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNMTP50135 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNMTP50135 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNMTP50135 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNMTP50135 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNMTP50135 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNMTP50135 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNMTP50135 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNMTP50135 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNMTP50135 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNMTP50135 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNMTP50135 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNMTP50135 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HNMTP50135 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HNMTP50135 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HNMTP50135 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HNMTP50135 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HNMTP50135 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HNMTP50135 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNMTP50135 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNMTP50135 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNMTP50135 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNMTP50135 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNMTP50135 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HNMTP50135 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNMTP50135 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HNMTP50135 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNMTP50135 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNMTP50135 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNMTP50135 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNMTP50135 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNMTP50135 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNMTP50135 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNMTP50135 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNMTP50135 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HNMTP50135 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HNMTP50135 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNMTP50135 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNMTP50135 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNMTP50135 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNMTP50135 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNMTP50135 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNMTP50135 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNMTP50135 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.4 ms