Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK1P49759 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK1P49759 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK1P49759 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK1P49759 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK1P49759 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK1P49759 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK1P49759 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK1P49759 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK1P49759 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK1P49759 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK1P49759 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK1P49759 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK1P49759 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLK1P49759 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLK1P49759 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLK1P49759 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLK1P49759 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLK1P49759 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLK1P49759 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLK1P49759 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK1P49759 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK1P49759 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK1P49759 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK1P49759 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK1P49759 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK1P49759 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK1P49759 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK1P49759 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK1P49759 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK1P49759 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLK1P49759 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLK1P49759 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLK1P49759 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLK1P49759 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLK1P49759 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLK1P49759 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLK1P49759 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLK1P49759 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLK1P49759 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CLK1P49759 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLK1P49759 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLK1P49759 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLK1P49759 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLK1P49759 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLK1P49759 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CLK1P49759 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLK1P49759 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLK1P49759 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLK1P49759 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLK1P49759 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLK1P49759 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLK1P49759 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLK1P49759 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLK1P49759 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLK1P49759 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLK1P49759 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLK1P49759 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLK1P49759 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLK1P49759 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLK1P49759 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLK1P49759 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLK1P49759 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLK1P49759 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLK1P49759 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms