Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPIAP49247 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPIAP49247 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPIAP49247 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPIAP49247 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPIAP49247 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPIAP49247 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPIAP49247 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPIAP49247 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPIAP49247 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPIAP49247 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPIAP49247 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPIAP49247 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPIAP49247 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPIAP49247 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPIAP49247 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPIAP49247 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPIAP49247 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPIAP49247 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPIAP49247 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPIAP49247 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPIAP49247 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPIAP49247 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPIAP49247 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPIAP49247 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPIAP49247 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPIAP49247 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPIAP49247 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPIAP49247 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPIAP49247 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPIAP49247 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPIAP49247 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPIAP49247 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPIAP49247 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPIAP49247 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPIAP49247 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPIAP49247 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPIAP49247 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPIAP49247 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPIAP49247 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPIAP49247 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPIAP49247 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPIAP49247 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPIAP49247 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPIAP49247 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPIAP49247 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPIAP49247 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPIAP49247 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPIAP49247 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPIAP49247 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPIAP49247 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPIAP49247 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPIAP49247 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPIAP49247 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPIAP49247 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPIAP49247 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPIAP49247 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPIAP49247 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPIAP49247 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPIAP49247 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPIAP49247 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPIAP49247 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPIAP49247 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPIAP49247 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPIAP49247 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPIAP49247 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPIAP49247 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPIAP49247 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPIAP49247 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPIAP49247 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPIAP49247 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPIAP49247 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPIAP49247 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPIAP49247 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPIAP49247 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPIAP49247 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPIAP49247 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPIAP49247 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPIAP49247 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPIAP49247 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPIAP49247 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPIAP49247 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPIAP49247 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPIAP49247 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPIAP49247 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPIAP49247 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPIAP49247 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPIAP49247 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPIAP49247 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPIAP49247 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPIAP49247 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPIAP49247 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPIAP49247 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPIAP49247 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPIAP49247 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPIAP49247 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPIAP49247 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPIAP49247 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPIAP49247 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPIAP49247 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms