Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMUP48645 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMUP48645 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMUP48645 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMUP48645 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMUP48645 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMUP48645 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMUP48645 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMUP48645 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMUP48645 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMUP48645 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMUP48645 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMUP48645 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMUP48645 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMUP48645 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMUP48645 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMUP48645 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMUP48645 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMUP48645 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMUP48645 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMUP48645 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMUP48645 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMUP48645 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMUP48645 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMUP48645 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMUP48645 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMUP48645 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMUP48645 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NMUP48645 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMUP48645 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMUP48645 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMUP48645 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMUP48645 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMUP48645 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMUP48645 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMUP48645 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMUP48645 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMUP48645 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMUP48645 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMUP48645 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NMUP48645 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMUP48645 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMUP48645 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NMUP48645 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NMUP48645 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NMUP48645 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NMUP48645 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NMUP48645 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMUP48645 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMUP48645 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMUP48645 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMUP48645 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMUP48645 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMUP48645 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMUP48645 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMUP48645 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMUP48645 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMUP48645 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMUP48645 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMUP48645 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMUP48645 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMUP48645 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMUP48645 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMUP48645 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMUP48645 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMUP48645 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMUP48645 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMUP48645 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMUP48645 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMUP48645 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NMUP48645 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NMUP48645 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NMUP48645 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NMUP48645 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NMUP48645 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NMUP48645 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms