Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFMP43652 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFMP43652 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFMP43652 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFMP43652 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFMP43652 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFMP43652 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFMP43652 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFMP43652 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFMP43652 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFMP43652 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFMP43652 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFMP43652 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFMP43652 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFMP43652 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFMP43652 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFMP43652 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFMP43652 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFMP43652 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFMP43652 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFMP43652 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFMP43652 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFMP43652 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFMP43652 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFMP43652 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
AFMP43652 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFMP43652 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFMP43652 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFMP43652 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFMP43652 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFMP43652 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AFMP43652 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AFMP43652 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFMP43652 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFMP43652 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFMP43652 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFMP43652 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFMP43652 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFMP43652 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFMP43652 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFMP43652 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFMP43652 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
AFMP43652 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFMP43652 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFMP43652 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFMP43652 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
AFMP43652 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFMP43652 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFMP43652 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFMP43652 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFMP43652 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFMP43652 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFMP43652 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFMP43652 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFMP43652 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFMP43652 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFMP43652 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFMP43652 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFMP43652 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFMP43652 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFMP43652 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFMP43652 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFMP43652 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFMP43652 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFMP43652 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFMP43652 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFMP43652 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFMP43652 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFMP43652 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFMP43652 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFMP43652 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AFMP43652 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AFMP43652 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFMP43652 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFMP43652 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFMP43652 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFMP43652 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFMP43652 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFMP43652 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFMP43652 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFMP43652 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFMP43652 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFMP43652 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFMP43652 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFMP43652 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFMP43652 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFMP43652 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFMP43652 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFMP43652 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFMP43652 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFMP43652 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFMP43652 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFMP43652 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
AFMP43652 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AFMP43652 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFMP43652 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFMP43652 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFMP43652 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFMP43652 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFMP43652 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms