Protein–RNA interactions for Protein: P43243

MATR3, Matrin-3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATR3P43243 MSI2-213ENST00000581523 534 ntTSL 24.63□□□□□ -1.672e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 MSI2-211ENST00000579531 472 ntTSL 24.06□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 STXBP6-207ENST00000550887 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.194e-6■■■■■ 27.4
MATR3P43243 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.124e-6■■■■■ 27.4
MATR3P43243 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.844e-6■■■■■ 27.4
MATR3P43243 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 27.4
MATR3P43243 PTBP2-209ENST00000482253 2029 ntTSL 220.15■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 PTBP2-201ENST00000370197 3057 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.883e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 PTBP2-202ENST00000370198 3054 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 PTBP2-207ENST00000476419 1691 ntTSL 1 (best)9.12□□□□□ -0.953e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.833e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.13e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.883e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 CHD1L-205ENST00000467213 2782 ntTSL 1 (best)17.14■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.043e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 CHD1L-210ENST00000622533 2937 ntTSL 514.55□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 CHD1L-208ENST00000488864 2415 ntTSL 214.45□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 DLEU1-203ENST00000461527 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 DLEU1-218ENST00000475913 534 ntTSL 1 (best)13.75□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 TMLHE-201ENST00000334398 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 27.4
MATR3P43243 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 CUL1-203ENST00000602748 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 DLEU1-208ENST00000468168 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 DLEU1-232ENST00000491341 1141 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.393e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 DLEU1-219ENST00000476738 838 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 DLEU1-207ENST00000467721 1455 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 DLEU1-229ENST00000486895 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 DLEU1-209ENST00000468522 1158 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 IDH3B-205ENST00000466999 521 ntTSL 211.32□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 CUL1-202ENST00000409469 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.683e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 DLEU1-234ENST00000491615 1451 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 DLEU1-206ENST00000463474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 DLEU1-228ENST00000485007 736 ntTSL 59.77□□□□□ -0.853e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 DLEU1-225ENST00000484529 400 ntTSL 1 (best)9.66□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.393e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 27.4
MATR3P43243 UGGT2-208ENST00000465196 610 ntTSL 34.92□□□□□ -1.623e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 UGGT2-209ENST00000467305 910 ntTSL 34.32□□□□□ -1.723e-7■■■■■ 27.4
MATR3P43243 TMLHE-205ENST00000474677 298 ntTSL 34.23□□□□□ -1.732e-6■■■■■ 27.4
MATR3P43243 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 27.4
MATR3P43243 TCAF1-204ENST00000478172 576 ntTSL 411.54□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 27.4
MATR3P43243 TCAF1-201ENST00000355951 3343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 27.4
MATR3P43243 PPP6R3-215ENST00000528635 538 ntTSL 417.25■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PPP6R3-217ENST00000529344 603 ntTSL 417.25■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PPP6R3-204ENST00000393801 5069 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PPP6R3-203ENST00000393800 5093 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.386e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PPP6R3-220ENST00000530427 560 ntTSL 512.5□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.446e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PPP6R3-205ENST00000524845 2771 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.516e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PPP6R3-226ENST00000534534 2968 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.526e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PPP6R3-202ENST00000265637 4783 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.546e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PPP6R3-224ENST00000533127 551 ntTSL 410.73□□□□□ -0.696e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PPP6R3-219ENST00000529907 826 ntTSL 510.73□□□□□ -0.696e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.936e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.056e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 BRD7-201ENST00000394688 5370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.435e-9■■■■■ 27.3
MATR3P43243 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.895e-9■■■■■ 27.3
MATR3P43243 U2AF2-207ENST00000592867 447 ntTSL 218■□□□□ 0.472e-14■■■■■ 27.3
MATR3P43243 U2AF2-205ENST00000588850 637 ntTSL 216.66■□□□□ 0.262e-14■■■■■ 27.3
MATR3P43243 U2AF2-203ENST00000587196 778 ntTSL 315.51■□□□□ 0.072e-14■■■■■ 27.3
MATR3P43243 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 EXOC2-201ENST00000230449 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PTK2-218ENST00000519993 4388 ntTSL 1 (best)20.2■□□□□ 0.829e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.119e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.039e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.049e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.149e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.239e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PTK2-215ENST00000519654 4129 ntTSL 1 (best)6.61□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 27.3
MATR3P43243 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.499e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 SGMS1-211ENST00000626236 1013 ntTSL 1 (best)9.33□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 27.3
MATR3P43243 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 27.3
MATR3P43243 SGMS1-207ENST00000602619 461 ntTSL 32.73□□□□□ -1.972e-6■■■■■ 27.3
MATR3P43243 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.65e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 OSBPL9-209ENST00000473207 578 ntTSL 416.85■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 OSBPL9-225ENST00000533884 595 ntTSL 416.85■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 OSBPL9-211ENST00000481937 630 ntTSL 316.34■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 OSBPL9-207ENST00000462759 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 OSBPL9-217ENST00000526917 663 ntTSL 313.15□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 OSBPL9-213ENST00000486942 2529 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 OSBPL9-226ENST00000534040 575 ntTSL 45.72□□□□□ -1.495e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 OSBPL9-223ENST00000532975 581 ntTSL 45.72□□□□□ -1.495e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 OSBPL9-218ENST00000527631 563 ntTSL 43.55□□□□□ -1.845e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.28e-7■■■■■ 27.3
MATR3P43243 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.628e-7■■■■■ 27.3
Retrieved 100 of 16,209 protein–RNA pairs in 74.7 ms