Protein–RNA interactions for Protein: P41968

MC3R, Melanocortin receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC3RP41968 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC3RP41968 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC3RP41968 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC3RP41968 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MC3RP41968 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MC3RP41968 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC3RP41968 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MC3RP41968 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC3RP41968 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC3RP41968 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC3RP41968 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC3RP41968 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC3RP41968 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC3RP41968 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC3RP41968 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC3RP41968 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MC3RP41968 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC3RP41968 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC3RP41968 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC3RP41968 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC3RP41968 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC3RP41968 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MC3RP41968 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MC3RP41968 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MC3RP41968 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MC3RP41968 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC3RP41968 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC3RP41968 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC3RP41968 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MC3RP41968 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MC3RP41968 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC3RP41968 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC3RP41968 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC3RP41968 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC3RP41968 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MC3RP41968 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC3RP41968 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC3RP41968 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC3RP41968 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC3RP41968 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC3RP41968 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC3RP41968 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC3RP41968 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC3RP41968 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC3RP41968 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC3RP41968 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC3RP41968 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MC3RP41968 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MC3RP41968 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MC3RP41968 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MC3RP41968 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MC3RP41968 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MC3RP41968 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MC3RP41968 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MC3RP41968 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MC3RP41968 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MC3RP41968 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MC3RP41968 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MC3RP41968 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MC3RP41968 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MC3RP41968 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MC3RP41968 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MC3RP41968 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MC3RP41968 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MC3RP41968 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MC3RP41968 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MC3RP41968 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MC3RP41968 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MC3RP41968 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MC3RP41968 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MC3RP41968 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MC3RP41968 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC3RP41968 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC3RP41968 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC3RP41968 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC3RP41968 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC3RP41968 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC3RP41968 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC3RP41968 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC3RP41968 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC3RP41968 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC3RP41968 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC3RP41968 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MC3RP41968 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MC3RP41968 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MC3RP41968 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MC3RP41968 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MC3RP41968 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MC3RP41968 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MC3RP41968 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MC3RP41968 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MC3RP41968 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MC3RP41968 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MC3RP41968 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MC3RP41968 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MC3RP41968 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MC3RP41968 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MC3RP41968 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MC3RP41968 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MC3RP41968 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms