Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBEC1P41238 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBEC1P41238 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms