Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP8P40818 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP8P40818 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP8P40818 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP8P40818 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP8P40818 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP8P40818 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP8P40818 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP8P40818 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP8P40818 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP8P40818 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP8P40818 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP8P40818 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP8P40818 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP8P40818 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP8P40818 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP8P40818 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP8P40818 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP8P40818 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP8P40818 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP8P40818 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP8P40818 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP8P40818 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP8P40818 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP8P40818 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP8P40818 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP8P40818 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP8P40818 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP8P40818 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP8P40818 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP8P40818 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP8P40818 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP8P40818 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP8P40818 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP8P40818 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP8P40818 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP8P40818 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP8P40818 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP8P40818 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP8P40818 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP8P40818 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP8P40818 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP8P40818 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP8P40818 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP8P40818 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP8P40818 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP8P40818 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP8P40818 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP8P40818 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP8P40818 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP8P40818 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP8P40818 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP8P40818 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP8P40818 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP8P40818 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP8P40818 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP8P40818 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP8P40818 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP8P40818 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP8P40818 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP8P40818 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP8P40818 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP8P40818 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP8P40818 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP8P40818 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP8P40818 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP8P40818 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP8P40818 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP8P40818 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP8P40818 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP8P40818 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP8P40818 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP8P40818 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP8P40818 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP8P40818 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP8P40818 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP8P40818 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP8P40818 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP8P40818 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP8P40818 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP8P40818 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP8P40818 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP8P40818 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP8P40818 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms