Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC1P35251 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC1P35251 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC1P35251 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC1P35251 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC1P35251 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC1P35251 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC1P35251 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC1P35251 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC1P35251 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC1P35251 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC1P35251 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC1P35251 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC1P35251 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC1P35251 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC1P35251 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC1P35251 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC1P35251 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC1P35251 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC1P35251 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC1P35251 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC1P35251 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC1P35251 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC1P35251 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC1P35251 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC1P35251 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC1P35251 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC1P35251 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC1P35251 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC1P35251 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC1P35251 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC1P35251 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC1P35251 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC1P35251 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC1P35251 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC1P35251 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC1P35251 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC1P35251 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC1P35251 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC1P35251 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC1P35251 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC1P35251 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC1P35251 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC1P35251 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC1P35251 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC1P35251 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC1P35251 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC1P35251 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC1P35251 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC1P35251 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFC1P35251 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RFC1P35251 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFC1P35251 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFC1P35251 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFC1P35251 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFC1P35251 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFC1P35251 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFC1P35251 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFC1P35251 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFC1P35251 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RFC1P35251 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFC1P35251 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFC1P35251 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFC1P35251 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC1P35251 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC1P35251 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC1P35251 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC1P35251 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC1P35251 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC1P35251 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC1P35251 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC1P35251 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC1P35251 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC1P35251 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC1P35251 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC1P35251 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC1P35251 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC1P35251 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC1P35251 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC1P35251 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC1P35251 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC1P35251 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC1P35251 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC1P35251 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC1P35251 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC1P35251 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC1P35251 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC1P35251 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC1P35251 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC1P35251 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC1P35251 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC1P35251 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC1P35251 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC1P35251 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC1P35251 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC1P35251 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC1P35251 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC1P35251 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC1P35251 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC1P35251 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms