Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR2P33947 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDELR2P33947 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KDELR2P33947 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms