Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1CAMP32004 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1CAMP32004 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms