Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRMP28827 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRMP28827 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRMP28827 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
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