Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VARSP26640 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VARSP26640 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VARSP26640 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VARSP26640 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VARSP26640 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VARSP26640 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VARSP26640 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VARSP26640 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VARSP26640 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VARSP26640 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VARSP26640 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VARSP26640 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VARSP26640 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VARSP26640 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VARSP26640 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VARSP26640 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VARSP26640 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VARSP26640 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VARSP26640 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VARSP26640 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VARSP26640 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VARSP26640 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VARSP26640 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VARSP26640 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VARSP26640 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VARSP26640 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VARSP26640 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VARSP26640 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VARSP26640 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VARSP26640 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VARSP26640 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VARSP26640 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VARSP26640 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VARSP26640 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VARSP26640 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VARSP26640 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VARSP26640 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VARSP26640 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VARSP26640 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VARSP26640 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VARSP26640 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VARSP26640 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VARSP26640 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VARSP26640 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VARSP26640 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VARSP26640 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VARSP26640 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VARSP26640 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VARSP26640 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VARSP26640 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VARSP26640 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VARSP26640 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VARSP26640 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VARSP26640 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VARSP26640 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VARSP26640 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VARSP26640 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VARSP26640 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VARSP26640 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VARSP26640 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VARSP26640 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VARSP26640 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VARSP26640 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VARSP26640 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VARSP26640 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VARSP26640 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VARSP26640 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VARSP26640 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VARSP26640 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VARSP26640 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VARSP26640 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VARSP26640 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VARSP26640 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VARSP26640 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VARSP26640 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VARSP26640 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VARSP26640 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VARSP26640 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VARSP26640 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VARSP26640 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VARSP26640 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VARSP26640 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VARSP26640 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VARSP26640 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VARSP26640 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VARSP26640 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VARSP26640 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VARSP26640 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VARSP26640 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VARSP26640 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VARSP26640 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VARSP26640 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VARSP26640 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VARSP26640 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VARSP26640 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VARSP26640 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VARSP26640 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VARSP26640 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VARSP26640 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms