Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN3P26045 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN3P26045 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN3P26045 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms