Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms