Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRKACBP22694 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms