Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF7P17544 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATF7P17544 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF7P17544 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF7P17544 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF7P17544 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF7P17544 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF7P17544 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF7P17544 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF7P17544 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF7P17544 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF7P17544 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF7P17544 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF7P17544 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF7P17544 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF7P17544 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF7P17544 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF7P17544 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF7P17544 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF7P17544 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF7P17544 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF7P17544 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF7P17544 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF7P17544 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF7P17544 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF7P17544 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF7P17544 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF7P17544 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF7P17544 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF7P17544 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF7P17544 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATF7P17544 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF7P17544 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF7P17544 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF7P17544 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF7P17544 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF7P17544 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATF7P17544 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF7P17544 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF7P17544 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF7P17544 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF7P17544 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATF7P17544 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF7P17544 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF7P17544 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATF7P17544 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATF7P17544 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATF7P17544 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF7P17544 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF7P17544 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF7P17544 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF7P17544 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF7P17544 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF7P17544 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF7P17544 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF7P17544 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF7P17544 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF7P17544 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATF7P17544 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF7P17544 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF7P17544 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF7P17544 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF7P17544 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF7P17544 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF7P17544 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF7P17544 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATF7P17544 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF7P17544 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF7P17544 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF7P17544 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF7P17544 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF7P17544 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF7P17544 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF7P17544 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF7P17544 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATF7P17544 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF7P17544 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF7P17544 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF7P17544 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF7P17544 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATF7P17544 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF7P17544 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF7P17544 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF7P17544 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF7P17544 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF7P17544 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF7P17544 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF7P17544 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF7P17544 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF7P17544 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATF7P17544 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF7P17544 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF7P17544 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF7P17544 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATF7P17544 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF7P17544 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF7P17544 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF7P17544 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF7P17544 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATF7P17544 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms