Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCFC2P16383 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCFC2P16383 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms