Protein–RNA interactions for Protein: P0DP03

IGHV3-30-5, Immunoglobulin heavy variable 3-30-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-5P0DP03 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IGHV3-30-5P0DP03 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IGHV3-30-5P0DP03 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms