Protein–RNA interactions for Protein: P0DP02

IGHV3-30-3, Immunoglobulin heavy variable 3-30-3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-3P0DP02 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IGHV3-30-3P0DP02 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-3P0DP02 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms