Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM49P0CI25 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM49P0CI25 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms