Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXB7P09629 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXB7P09629 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXB7P09629 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms