Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IL3P08700 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IL3P08700 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IL3P08700 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IL3P08700 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IL3P08700 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IL3P08700 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IL3P08700 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IL3P08700 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IL3P08700 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IL3P08700 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IL3P08700 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IL3P08700 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IL3P08700 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IL3P08700 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL3P08700 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL3P08700 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL3P08700 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL3P08700 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL3P08700 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL3P08700 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL3P08700 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL3P08700 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL3P08700 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL3P08700 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IL3P08700 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL3P08700 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL3P08700 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IL3P08700 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IL3P08700 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IL3P08700 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IL3P08700 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IL3P08700 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IL3P08700 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IL3P08700 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IL3P08700 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL3P08700 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL3P08700 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL3P08700 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL3P08700 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL3P08700 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL3P08700 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL3P08700 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL3P08700 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL3P08700 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL3P08700 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL3P08700 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IL3P08700 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IL3P08700 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IL3P08700 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL3P08700 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL3P08700 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL3P08700 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL3P08700 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IL3P08700 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL3P08700 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL3P08700 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3P08700 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3P08700 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3P08700 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3P08700 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3P08700 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3P08700 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3P08700 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3P08700 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3P08700 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3P08700 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3P08700 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3P08700 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3P08700 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3P08700 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3P08700 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL3P08700 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL3P08700 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL3P08700 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL3P08700 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL3P08700 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL3P08700 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL3P08700 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL3P08700 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL3P08700 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL3P08700 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL3P08700 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms