Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRCP08575 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRCP08575 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRCP08575 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms