Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA4P06727 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA4P06727 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA4P06727 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA4P06727 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOA4P06727 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOA4P06727 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOA4P06727 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOA4P06727 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOA4P06727 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOA4P06727 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOA4P06727 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOA4P06727 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA4P06727 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA4P06727 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA4P06727 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA4P06727 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APOA4P06727 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA4P06727 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA4P06727 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA4P06727 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA4P06727 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOA4P06727 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA4P06727 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA4P06727 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA4P06727 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA4P06727 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA4P06727 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA4P06727 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA4P06727 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA4P06727 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOA4P06727 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA4P06727 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA4P06727 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA4P06727 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA4P06727 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA4P06727 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA4P06727 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA4P06727 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA4P06727 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA4P06727 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA4P06727 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA4P06727 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOA4P06727 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA4P06727 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA4P06727 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA4P06727 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA4P06727 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA4P06727 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOA4P06727 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA4P06727 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA4P06727 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA4P06727 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA4P06727 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA4P06727 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA4P06727 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA4P06727 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOA4P06727 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA4P06727 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA4P06727 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA4P06727 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA4P06727 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA4P06727 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA4P06727 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA4P06727 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOA4P06727 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA4P06727 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA4P06727 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA4P06727 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA4P06727 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA4P06727 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA4P06727 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA4P06727 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOA4P06727 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA4P06727 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA4P06727 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA4P06727 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA4P06727 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA4P06727 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA4P06727 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA4P06727 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA4P06727 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA4P06727 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA4P06727 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA4P06727 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA4P06727 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOA4P06727 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA4P06727 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA4P06727 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA4P06727 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA4P06727 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA4P06727 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA4P06727 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA4P06727 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA4P06727 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA4P06727 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA4P06727 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA4P06727 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOA4P06727 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA4P06727 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms