Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IGHDP01880 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IGHDP01880 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IGHDP01880 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGHDP01880 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGHDP01880 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGHDP01880 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGHDP01880 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGHDP01880 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGHDP01880 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGHDP01880 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
IGHDP01880 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGHDP01880 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGHDP01880 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IGHDP01880 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGHDP01880 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGHDP01880 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGHDP01880 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGHDP01880 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGHDP01880 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGHDP01880 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGHDP01880 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGHDP01880 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGHDP01880 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGHDP01880 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGHDP01880 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGHDP01880 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGHDP01880 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGHDP01880 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGHDP01880 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGHDP01880 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGHDP01880 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGHDP01880 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGHDP01880 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGHDP01880 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IGHDP01880 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IGHDP01880 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IGHDP01880 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IGHDP01880 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IGHDP01880 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IGHDP01880 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IGHDP01880 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
IGHDP01880 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IGHDP01880 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IGHDP01880 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IGHDP01880 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
IGHDP01880 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGHDP01880 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGHDP01880 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGHDP01880 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGHDP01880 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGHDP01880 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGHDP01880 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGHDP01880 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGHDP01880 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGHDP01880 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGHDP01880 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGHDP01880 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGHDP01880 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGHDP01880 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGHDP01880 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGHDP01880 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGHDP01880 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGHDP01880 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGHDP01880 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGHDP01880 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGHDP01880 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGHDP01880 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGHDP01880 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGHDP01880 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGHDP01880 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGHDP01880 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGHDP01880 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGHDP01880 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGHDP01880 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGHDP01880 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGHDP01880 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGHDP01880 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGHDP01880 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGHDP01880 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGHDP01880 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGHDP01880 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGHDP01880 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGHDP01880 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGHDP01880 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGHDP01880 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGHDP01880 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGHDP01880 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGHDP01880 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGHDP01880 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGHDP01880 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGHDP01880 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGHDP01880 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
IGHDP01880 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
IGHDP01880 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
IGHDP01880 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGHDP01880 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGHDP01880 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGHDP01880 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGHDP01880 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms