Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IGHG1P01857 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGHG1P01857 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms