Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHAP00338 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHAP00338 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHAP00338 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHAP00338 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHAP00338 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHAP00338 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHAP00338 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHAP00338 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHAP00338 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHAP00338 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHAP00338 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHAP00338 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDHAP00338 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDHAP00338 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDHAP00338 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDHAP00338 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDHAP00338 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDHAP00338 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDHAP00338 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDHAP00338 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDHAP00338 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDHAP00338 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDHAP00338 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LDHAP00338 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDHAP00338 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDHAP00338 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDHAP00338 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDHAP00338 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDHAP00338 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDHAP00338 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDHAP00338 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LDHAP00338 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDHAP00338 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LDHAP00338 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LDHAP00338 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LDHAP00338 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LDHAP00338 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LDHAP00338 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LDHAP00338 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LDHAP00338 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDHAP00338 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDHAP00338 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDHAP00338 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDHAP00338 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDHAP00338 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LDHAP00338 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LDHAP00338 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDHAP00338 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDHAP00338 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDHAP00338 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LDHAP00338 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LDHAP00338 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LDHAP00338 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LDHAP00338 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDHAP00338 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDHAP00338 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDHAP00338 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDHAP00338 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDHAP00338 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LDHAP00338 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDHAP00338 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDHAP00338 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHAP00338 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHAP00338 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHAP00338 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHAP00338 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHAP00338 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHAP00338 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHAP00338 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHAP00338 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHAP00338 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LDHAP00338 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHAP00338 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHAP00338 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHAP00338 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHAP00338 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHAP00338 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHAP00338 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHAP00338 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHAP00338 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHAP00338 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHAP00338 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHAP00338 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHAP00338 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHAP00338 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHAP00338 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHAP00338 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHAP00338 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHAP00338 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHAP00338 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHAP00338 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHAP00338 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHAP00338 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHAP00338 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHAP00338 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHAP00338 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHAP00338 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHAP00338 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHAP00338 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms