Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFT2D2O95562 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D2O95562 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms