Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE8BO95263 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE8BO95263 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms