Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24DO94855 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC24DO94855 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms