Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSDE1O75534 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSDE1O75534 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms