Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS26AO75436 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS26AO75436 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms