Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GRIN3BO60391 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN3BO60391 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms