Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP104O60308 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP104O60308 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP104O60308 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP104O60308 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP104O60308 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CEP104O60308 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP104O60308 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP104O60308 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP104O60308 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP104O60308 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP104O60308 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP104O60308 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP104O60308 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP104O60308 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP104O60308 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP104O60308 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP104O60308 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP104O60308 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP104O60308 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP104O60308 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP104O60308 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP104O60308 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP104O60308 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP104O60308 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP104O60308 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP104O60308 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP104O60308 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP104O60308 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP104O60308 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP104O60308 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP104O60308 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP104O60308 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP104O60308 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP104O60308 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP104O60308 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP104O60308 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP104O60308 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP104O60308 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP104O60308 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP104O60308 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP104O60308 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP104O60308 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP104O60308 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP104O60308 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP104O60308 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP104O60308 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP104O60308 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP104O60308 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP104O60308 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP104O60308 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP104O60308 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP104O60308 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP104O60308 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP104O60308 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP104O60308 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP104O60308 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP104O60308 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP104O60308 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP104O60308 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP104O60308 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP104O60308 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP104O60308 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP104O60308 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP104O60308 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP104O60308 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP104O60308 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP104O60308 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP104O60308 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP104O60308 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP104O60308 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP104O60308 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP104O60308 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP104O60308 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP104O60308 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP104O60308 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP104O60308 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP104O60308 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP104O60308 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP104O60308 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP104O60308 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP104O60308 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP104O60308 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP104O60308 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms