Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51CO43502 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51CO43502 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD51CO43502 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms