Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUV39H1O43463 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SUV39H1O43463 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SUV39H1O43463 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SUV39H1O43463 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUV39H1O43463 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUV39H1O43463 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUV39H1O43463 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUV39H1O43463 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUV39H1O43463 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms