Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC8O43402 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC8O43402 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC8O43402 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC8O43402 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC8O43402 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC8O43402 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC8O43402 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC8O43402 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC8O43402 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC8O43402 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC8O43402 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC8O43402 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC8O43402 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC8O43402 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC8O43402 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC8O43402 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC8O43402 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC8O43402 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC8O43402 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC8O43402 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC8O43402 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMC8O43402 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMC8O43402 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMC8O43402 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMC8O43402 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMC8O43402 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMC8O43402 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMC8O43402 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC8O43402 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC8O43402 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC8O43402 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC8O43402 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC8O43402 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC8O43402 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC8O43402 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC8O43402 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC8O43402 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC8O43402 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC8O43402 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC8O43402 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC8O43402 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC8O43402 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC8O43402 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC8O43402 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC8O43402 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC8O43402 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC8O43402 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC8O43402 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC8O43402 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC8O43402 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC8O43402 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC8O43402 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC8O43402 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMC8O43402 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMC8O43402 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMC8O43402 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMC8O43402 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMC8O43402 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMC8O43402 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMC8O43402 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMC8O43402 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EMC8O43402 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EMC8O43402 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC8O43402 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC8O43402 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC8O43402 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC8O43402 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC8O43402 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC8O43402 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC8O43402 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC8O43402 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC8O43402 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC8O43402 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC8O43402 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC8O43402 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC8O43402 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC8O43402 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC8O43402 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC8O43402 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC8O43402 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC8O43402 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC8O43402 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC8O43402 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC8O43402 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC8O43402 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC8O43402 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC8O43402 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC8O43402 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC8O43402 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC8O43402 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC8O43402 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC8O43402 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC8O43402 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC8O43402 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC8O43402 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC8O43402 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC8O43402 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC8O43402 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC8O43402 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms