Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms