Protein–RNA interactions for Protein: O15321

TM9SF1, Transmembrane 9 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF1O15321 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM9SF1O15321 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TM9SF1O15321 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms