Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAMP3O14828 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms