Protein–RNA interactions for Protein: O14521

SDHD, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHDO14521 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDHDO14521 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDHDO14521 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHDO14521 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHDO14521 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHDO14521 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHDO14521 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHDO14521 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHDO14521 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHDO14521 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHDO14521 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHDO14521 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHDO14521 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHDO14521 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHDO14521 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHDO14521 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHDO14521 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHDO14521 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHDO14521 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHDO14521 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHDO14521 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHDO14521 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHDO14521 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHDO14521 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHDO14521 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHDO14521 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHDO14521 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHDO14521 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHDO14521 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHDO14521 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHDO14521 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHDO14521 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHDO14521 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHDO14521 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHDO14521 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHDO14521 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHDO14521 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHDO14521 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHDO14521 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHDO14521 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHDO14521 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHDO14521 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHDO14521 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHDO14521 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHDO14521 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHDO14521 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHDO14521 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHDO14521 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHDO14521 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHDO14521 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHDO14521 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHDO14521 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHDO14521 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHDO14521 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHDO14521 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDHDO14521 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHDO14521 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHDO14521 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHDO14521 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHDO14521 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHDO14521 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHDO14521 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHDO14521 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHDO14521 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHDO14521 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHDO14521 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHDO14521 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDHDO14521 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHDO14521 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHDO14521 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHDO14521 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHDO14521 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHDO14521 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHDO14521 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHDO14521 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHDO14521 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHDO14521 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDHDO14521 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHDO14521 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHDO14521 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHDO14521 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHDO14521 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHDO14521 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDHDO14521 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms