Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP1O00294 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP1O00294 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP1O00294 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP1O00294 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP1O00294 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP1O00294 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP1O00294 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP1O00294 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP1O00294 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP1O00294 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP1O00294 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP1O00294 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP1O00294 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP1O00294 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP1O00294 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP1O00294 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP1O00294 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP1O00294 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP1O00294 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP1O00294 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP1O00294 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP1O00294 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP1O00294 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP1O00294 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP1O00294 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP1O00294 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP1O00294 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP1O00294 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP1O00294 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP1O00294 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP1O00294 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP1O00294 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP1O00294 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP1O00294 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP1O00294 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP1O00294 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP1O00294 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TULP1O00294 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP1O00294 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP1O00294 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP1O00294 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP1O00294 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP1O00294 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP1O00294 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP1O00294 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP1O00294 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP1O00294 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP1O00294 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP1O00294 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP1O00294 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP1O00294 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP1O00294 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP1O00294 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP1O00294 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP1O00294 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP1O00294 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP1O00294 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP1O00294 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP1O00294 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP1O00294 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP1O00294 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP1O00294 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP1O00294 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP1O00294 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP1O00294 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP1O00294 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP1O00294 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP1O00294 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP1O00294 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP1O00294 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP1O00294 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP1O00294 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TULP1O00294 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TULP1O00294 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TULP1O00294 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TULP1O00294 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TULP1O00294 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TULP1O00294 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TULP1O00294 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TULP1O00294 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TULP1O00294 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TULP1O00294 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TULP1O00294 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TULP1O00294 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TULP1O00294 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TULP1O00294 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TULP1O00294 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TULP1O00294 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TULP1O00294 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TULP1O00294 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TULP1O00294 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP1O00294 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP1O00294 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP1O00294 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP1O00294 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP1O00294 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP1O00294 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP1O00294 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP1O00294 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms