Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3B1O00203 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3B1O00203 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B1O00203 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms