Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms