Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPIPB9F8W1W9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPB9F8W1W9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms