Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM114B3SHH9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM114B3SHH9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms