Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1CA8MV81 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1CA8MV81 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1CA8MV81 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1CA8MV81 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HIGD1CA8MV81 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms