Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PP2D1A8MPX8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms